La maldad de al-Ḥākim se extendió a todo el pueblo, incluso a su hermana. Acusaba a su hermana de prostitución y le decía palabras muy duras. Su hermana se enfureció con él y trató de matarlo. Se comunicó con Ibn Dawwās, el más grande de los comandantes. Ambos acordaron matar y eliminar a al-Ḥākim. Ibn Dawwās asignó esta tarea a dos valientes esclavos negros que tenía consigo y les dijo: "Estad en la montaña de Mukattam en tal noche, porque esa noche al-Ḥākim irá allí a mirar las estrellas. Solo irá acompañado por su portaequipajes y un esclavo joven. Matad a al-Ḥākim, así como a su portaequipajes y esclavo." Así se decidió. Aquella noche, al-Ḥākim le dijo a su madre: "Esta noche siento una gran angustia. Si sobrevivo a esto, viviré unos ochenta años. Pero aun así, lleva mis pertenencias contigo; temo sobre todo a mi hermana. Me preocupa que ella también pueda hacerte daño." Su madre llevó consigo las pertenencias de al-Ḥākim. En los cofres de al-Ḥākim había unos trescientos mil dinares y otras joyas. Su madre le dijo: "Oh mi señor, si la situación es como dices, entonces ten piedad de mí y no vayas a ese lugar esta noche." Su madre lo amaba mucho. Al-Ḥākim respondió: "No, debo ir." Según su costumbre, al-Ḥākim solía pasear alrededor del palacio cada noche. Esa noche también paseó. Luego regresó al palacio. Durmió hasta el último tercio de la noche, luego se despertó y dijo: "Si no voy a esa montaña esta noche, estallaré." Montó inmediatamente su caballo. Su joven esclavo y portaequipajes lo acompañaron. Subió la montaña de Mukattam. Los dos esclavos de Ibn Dawwās se le enfrentaron. Lo bajaron de su montura, le cortaron las manos y los pies, le abrieron el vientre y lo llevaron a su amo Ibn Dawwās.
Ibn Dawwās tomó el cadáver y lo llevó a la hermana de al-Ḥākim. Ella lo enterró en su propia casa. Se convocó a los grandes comandantes, a los notables y al visir, y se les explicó la situación. Ellos juraron lealtad al hijo de al-Ḥākim, Abū al-Ḥasan ʿAlī. Le dieron a Abū al-Ḥasan ʿAlī el título Zāhir li-ʾIʿzāz al-Dīnillāh. Sin embargo, Zāhir estaba en Damasco. Su tía lo llamó y comenzó a decir al pueblo: "Al-Ḥākim me dijo: Estaré ausente de aquí siete días, luego volveré a vosotros." El pueblo se calmó. Luego la hermana de al-Ḥākim ordenó a los dos portaequipajes de al-Ḥākim que fueran a la montaña, regresaran y dijeran al pueblo: "Dejamos a al-Ḥākim en tal lugar," y luego que fueran a decir lo mismo a su madre. Obedecieron esta orden. Finalmente, el pueblo se tranquilizó. La hermana de al-Ḥākim presentó a Zāhir li-ʾIʿzāz al-Dīnillāh.
Le envió un millón de dinares y dos millones de dirhams para que viniera desde Damasco. Cuando Zāhir llegó, ella le puso la corona de su abuelo Abū al-Muʿizz y un magnífico vestido. Lo sentó en el trono. Los emires y jefes le juraron lealtad. Él dio a los emires y jefes muchos regalos y dinero. La hermana de al-Ḥākim también vistió a Ibn Dawwās con prendas preciosas y magníficas. Luego durante tres días recibió condolencias por la muerte de su hermano al-Ḥākim. Después de eso, envió un grupo de soldados a Ibn Dawwās para que estuvieran con sus espadas en su presencia y le sirvieran. Luego un día les ordenó que le dijeran: "Eres el asesino de nuestro señor," y que lo despedazaran con sus espadas. Cumplieron esta orden. La hermana de al-Ḥākim mató a todos los que conocían el secreto del asesinato de al-Ḥākim. Su prestigio creció y su respeto aumentó.
Su influencia en la jerarquía estatal aumentó. Encontró estabilidad. Al-Ḥākim tenía treinta y siete años el día que fue asesinado. Había pasado veinticinco años de su vida en el gobierno.