Cuando la situación de al-Amīn se volvió crítica, reunió a sus comandantes, soldados y sirvientes, y les pidió consejo sobre su situación. Algunos dijeron: "Con los hombres que te quedan, ve a al-Jazīra o Siria. Allí puedes recaudar tributo, cobrar impuestos y poner a trabajar a tus hombres. Así te fortalecerás." Otros dijeron: "Ve a Ṭāhir, pídele amān (garantía de seguridad) y jura lealtad a tu hermano al-Maʾmūn. Si haces esto, tu hermano te dará a ti y a tu familia suficientes bienes mundanos. Tu objetivo es la comodidad y la tranquilidad, y esto estará completamente en tus manos." Otro grupo dijo: "Sería más apropiado ir a Harsema y pedirle amān, porque él es tu liberto y te mostrará mayor compasión."
Al-Amīn se inclinó por esta opinión y concertó una cita con Harsema para la noche del domingo, la cuarta noche del mes de Ṣafar, después de la oración nocturna. Luego se puso la túnica y el manto del califato y llamó a sus hijos a su lado. Los abrazó, aspirando su aroma y apretándolos contra su pecho. "Os encomiendo a Allah," dijo. Se secó las lágrimas con el borde de su manga. Luego montó un caballo negro, con una vela delante de él.
Cuando llegó junto a Harsema, este lo recibió con respeto y honor. Subieron a una barca en la orilla del Tigris. Cuando Ṭāhir se enteró de esto, se enfureció y dijo: "Yo soy quien ha logrado todo esto, y ahora al-Amīn va con Harsema. ¡Todos estos méritos se atribuirán a Harsema!" Fue y los atrapó en la barca, inclinándola para que los hombres que estaban dentro cayeran al agua y se ahogaran. Solo al-Amīn logró nadar hasta la orilla opuesta. Uno de los soldados lo capturó y comunicó la situación a Ṭāhir, quien entonces envió a varios soldados persas, ordenándoles que mataran a al-Amīn.
Los soldados llegaron a la casa donde se encontraba al-Amīn. Dentro, estaba presente un amigo de al-Amīn. Al-Amīn le dijo: "Ven a mi lado. Esta noche siento una soledad y una inquietud intensas." Después de decir esto, se envolvió fuertemente en su vestimenta, su corazón latía rápidamente, como si fuera a salirse de su pecho. Cuando los soldados persas entraron, al-Amīn dijo: "En verdad, pertenecemos a Allah y a Él hemos de volver." Entonces uno de los soldados se adelantó y le asestó un golpe de espada en la cabeza. Mientras lo golpeaban, al-Amīn decía: "¡Ay de vosotros! Soy primo del Mensajero de Dios (la paz sea con él). Soy hijo de Hārūn al-Rashīd. Soy hermano de al-Maʾmūn. Temed a Allah al matarme, ¡temed a Allah!" Los soldados no prestaron atención a sus palabras. Todos lo atacaron juntos, le cortaron la cabeza y cayó boca abajo al suelo. Llevaron su cabeza a Ṭāhir y dejaron su cuerpo en el suelo. Luego, por la mañana, vinieron, lo envolvieron en una manta de caballo y se lo llevaron. Este suceso ocurrió la cuarta noche de Ṣafar, en una noche de domingo de ese año.